• Aprobar el anteproyecto anual del presupuesto del FEEI.
• Recibir semestralmente los informes de las instituciones ejecutoras sobre la ejecución de los proyectos y programas financiados por el fondo, así como de la Contraloría General de la República. Para ello, deberá reunirse en mayo y octubre.
• Tomar las medidas necesarias para la correcta, eficiente y transparente aplicación de los recursos del FEEI.
• Constituir un Comité Técnico de apoyo para el monitoreo de los programas y proyectos aprobados, conforme a la experiencia requerida para la evaluación de los mismos.
• Aprobar, modificar, rechazar total o parcialmente los programas y proyectos recibidos, priorizarlos o someterlos a nuevos estudios.
• Establecer su reglamento interno.

La Secretaría Ejecutiva del Consejo, por ley, se encuentra a cargo de la Secretaría Técnica de Planificación (STP). Esta institución es responsable de la preparación de las reuniones, la custodia de sus resoluciones y demás documentos y la publicidad de sus actos.